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海量样本无从下手?这五种抽样算法分分钟搞定

 

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全文共1854字,预计学习时长4分钟

数据科学是研究算法的学科。本文介绍了一些常见的用于处理数据的抽样技术。

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图片来源:
unsplash.com/@gndclouds

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简单随机抽样

假设要从一个群体中选出一个集合,该集合中的每个成员选中的概率相等。

下列代码演示了如何从数据集中选择100个采样点。

sample_df = df.sample(100)

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分层抽样

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假设需要估计选举中每个候选人的平均票数。并且假设该国有3个城镇:

A镇有100万名工人,B镇有200万名工人,C镇有300万名退休人员。

在所有选民中抽取60个随机样本,但随机样本有可能不能很好地与这些城镇的特征相适应,因此会产生数据偏差,从而导致估算结果出现重大错误。

相反,如果分别从A,B和C镇抽取10,20和30个随机样本,那么,在相同的样本数的情况下,用该种方法估算的结果误差较小。

使用python可以很容易地做到这一点:

from sklearn.model_selection import train_test_splitX_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y,                                                    stratify=y,                                                     test_size=0.25)

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水塘抽样

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假设有未知数量的大项目流,并且只供迭代一次。
数据科学家可以创建一个算法,从项目流中随机选择一个项目以使每个项目抽中的概率相等。
如何实现这一步骤?

假设必须从无限大的项目流中抽取5个对象,这样每个对象被抽中的概率都相等。

import randomdef generator(max):

    number = 1
    while number < max:
        number += 1
        yield number

# Create as stream generator
stream = generator(10000)

# Doing Reservoir Sampling from the stream
k=5
reservoir = []
for i, element in enumerate(stream):
    if i+1<= k:
        reservoir.append(element)
    else:
        probability = k/(i+1)
        if random.random() < probability:
            # Select item in stream and remove one of the k items already selected
             reservoir[random.choice(range(0,k))] = element

print(reservoir)
------------------------------------
[1369, 4108, 9986, 828, 5589]

从数学上可以证明,在样本中,每个元素从项目流中被抽中的概率相等。

怎么做呢?

涉及到数学时,从小的问题着手总是有用的。

所以,假设要从一个只有3个项目的数据流中抽出其中2个。

由于水塘空间充足,可将项目1放入列表,同理,由于水塘空间仍然充足,可将项目2也放入列表。

再看项目3。事情就变得有趣了,项目3被抽中的概率为2/3.

现在来看看项目1被抽中的概率:

项目1被抽中的概率等于项目3被抽中的概率乘以项目1被随机选为数据流中其他两个项目的候补的概率,即:


2/3*1/2 = 1/3

因此,抽中项目1的概率为:

1–1/3 = 2/3

数据科学家可以对项目2使用完全相同的参数,并且将该参数运用于数据流中的其他更多项目。

因此,每个项目被抽中的概率相同:2/3或一般式k/n

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随机欠采样和过采样

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事实上,不均衡数据集十分常见。

重抽样是一种广泛用于处理极度不均衡数据集的技术。它指从多数类样本中排除部分样本(欠采样)和/或从少数类样本中添加更多样本(过采样)。

首先,创建一些不均衡数据的示例。

from sklearn.datasets import make_classification

X, y = make_classification(
    n_classes=2, class_sep=1.5, weights=[0.9, 0.1],
    n_informative=3, n_redundant=1, flip_y=0,
    n_features=20, n_clusters_per_class=1,
    n_samples=100, random_state=10
)

X = pd.DataFrame(X)
X['target'] = y

现可以使用以下方法进行随机过采样和欠采样:

num_0 = len(X[X['target']==0])num_1 = len(X[X['target']==1])print(num_0,num_1)

# random undersample

undersampled_data = pd.concat([ X[X['target']==0].sample(num_1) , X[X['target']==1] ])
print(len(undersampled_data))

# random oversample

oversampled_data = pd.concat([ X[X['target']==0] , X[X['target']==1].sample(num_0, replace=True) ])
print(len(oversampled_data))

------------------------------------------------------------
OUTPUT:
90 10
20
180

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使用Imbalanced-learn进行欠采样和过采样

Imbalanced-learn(imblearn)是一个解决不均衡数据集的Python语言包。

可提供多种方法进行欠采样和过采样。

1. 使用Tomek Links进行欠采样:

Imbalanced-learn提供的方法之一是Tomek Links,指的是在两个不同类的样本中最近邻的对方。

在这个算法中,最终要将多数类样本从Tomek Links中移除,这为分类器提供了一个更好的决策边界。

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from imblearn.under_sampling import TomekLinks

tl = TomekLinks(return_indices=True, ratio='majority')
X_tl, y_tl, id_tl = tl.fit_sample(X, y)

2. 使用SMOTE算法进行过采样

SMOTE算法(合成少数类过采样技术),即在已有的样本最近邻中,为少数类样本人工合成新样本。

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from imblearn.over_sampling import SMOTE

smote = SMOTE(ratio='minority')
X_sm, y_sm = smote.fit_sample(X, y)

Imblearn包中还有许多其他方法可用于欠采样(Cluster Centroids,NearMiss等)和过采样(ADASYN和bSMOTE)。

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结语

算法是数据科学的生命线。

抽样是数据科学中的一个重要课题。一个好的抽样策略有时可以推动整个项目发展。而错误的抽样策略可能会带来错误的结果。因此,应当谨慎选择抽样策略。

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编译组:张璐瑶、廖琴

相关链接:

https://towardsdatascience.com/the-5-sampling-algorithms-every-data-scientist-need-to-know-43c7bc11d17c
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